菌落PCR出現(xiàn)假陽性的原因:可能使用了錯(cuò)誤的PCR鑒定引物、樣品間交叉污染、PCR試劑的污染、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的污染、氣溶膠污染以及實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染。?
?1.使用了錯(cuò)誤的PCR鑒定引物?:
在進(jìn)行菌液PCR時(shí),如果使用了基因特異引物,可能會(huì)從游離的目的片段DNA上擴(kuò)增出條帶,而不是從重組質(zhì)粒上,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。推薦使用一對載體通用引物進(jìn)行菌液PCR鑒定,以減少假陽性的發(fā)生?。
2. ?樣品間交叉污染?:
樣品污染可能由于收集樣本的容器被污染、樣本放置時(shí)密封不嚴(yán)溢于容器外、容器外粘有樣本而造成相互間交叉污染。此外,樣本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染也可能導(dǎo)致標(biāo)本間污染?。
?3.PCR試劑的污染?:
在PCR試劑配制過程中,加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染,也是造成假陽性的原因之一?。
?4.PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的污染?:
PCR反應(yīng)中最主要最常見的污染問題是PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染。極微量的PCR產(chǎn)物污染就可形成假陽性?。
?5.氣溶膠污染?:
在空氣與液體面摩擦?xí)r可形成氣溶膠,劇烈地?fù)u動(dòng)反應(yīng)管、開蓋時(shí)、吸樣時(shí)及污染進(jìn)樣槍的反復(fù)吸樣都可形成氣溶膠而污染。一個(gè)氣溶膠顆??珊?8000拷貝,因而由其造成的污染是一個(gè)值得特別重視的問題?。
?6.實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染?:
由于克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)含量相當(dāng)高,且在純化過程中需用較多的用具及試劑,活細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒具有很強(qiáng)的生命力,其污染可能性也很大,這也是造成假陽性的一個(gè)重要原因?。
為了避免假陽性的出現(xiàn),應(yīng)采取適當(dāng)?shù)拇胧p少上述各種污染的可能性,如使用正確的PCR鑒定引物、嚴(yán)格操作規(guī)范、避免交叉污染等?。